Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF3Q9NR81 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF3Q9NR81 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms