Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C8orf4Q9NR00 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C8orf4Q9NR00 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms