Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
VTA1Q9NP79 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VTA1Q9NP79 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms