Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC8

GDPD2, Glycerophosphoinositol inositolphosphodiesterase GDPD2, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD2Q9HCC8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDPD2Q9HCC8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDPD2Q9HCC8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GDPD2Q9HCC8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GDPD2Q9HCC8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GDPD2Q9HCC8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GDPD2Q9HCC8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GDPD2Q9HCC8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GDPD2Q9HCC8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms