Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMURF2Q9HAU4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMURF2Q9HAU4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMURF2Q9HAU4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms