Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAH1

ZNF556, Zinc finger protein 556, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF556Q9HAH1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF556Q9HAH1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF556Q9HAH1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF556Q9HAH1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF556Q9HAH1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF556Q9HAH1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF556Q9HAH1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms