Protein–RNA interactions for Protein: Q9H714

RUBCNL, Protein RUBCNL-like, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNLQ9H714 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNLQ9H714 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNLQ9H714 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNLQ9H714 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUBCNLQ9H714 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUBCNLQ9H714 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUBCNLQ9H714 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUBCNLQ9H714 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUBCNLQ9H714 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUBCNLQ9H714 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RUBCNLQ9H714 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms