Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M9

EHD1, EH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1Q9H4M9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD1Q9H4M9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD1Q9H4M9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD1Q9H4M9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD1Q9H4M9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD1Q9H4M9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD1Q9H4M9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD1Q9H4M9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD1Q9H4M9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD1Q9H4M9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD1Q9H4M9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD1Q9H4M9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD1Q9H4M9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD1Q9H4M9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD1Q9H4M9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD1Q9H4M9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD1Q9H4M9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EHD1Q9H4M9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EHD1Q9H4M9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EHD1Q9H4M9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms