Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCXQ9H320 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VCXQ9H320 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCXQ9H320 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms