Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNMDQ9H2S6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNMDQ9H2S6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNMDQ9H2S6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms