Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSP1Q9GZU7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSP1Q9GZU7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms