Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM55Q9BYV6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM55Q9BYV6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM55Q9BYV6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms