Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PARD6BQ9BYG5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PARD6BQ9BYG5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARD6BQ9BYG5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms