Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSM14BQ9BX40 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
LSM14BQ9BX40 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSM14BQ9BX40 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms