Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC77Q9BR77 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC77Q9BR77 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms