Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAP1L3Q99457 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NAP1L3Q99457 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NAP1L3Q99457 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms