Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRPK1Q96SB4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPK1Q96SB4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRPK1Q96SB4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms