Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
IFT140Q96RY7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC41■■■■■ 4.15
IFT140Q96RY7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
IFT140Q96RY7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
IFT140Q96RY7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
IFT140Q96RY7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
IFT140Q96RY7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
IFT140Q96RY7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
IFT140Q96RY7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
IFT140Q96RY7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
IFT140Q96RY7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
IFT140Q96RY7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
IFT140Q96RY7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
IFT140Q96RY7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
IFT140Q96RY7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
IFT140Q96RY7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
IFT140Q96RY7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
IFT140Q96RY7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.95■■■■■ 4.15
IFT140Q96RY7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC40.93■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
IFT140Q96RY7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
IFT140Q96RY7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
IFT140Q96RY7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
IFT140Q96RY7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
IFT140Q96RY7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
IFT140Q96RY7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
IFT140Q96RY7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
IFT140Q96RY7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
IFT140Q96RY7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
IFT140Q96RY7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
IFT140Q96RY7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
IFT140Q96RY7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
IFT140Q96RY7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
IFT140Q96RY7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
IFT140Q96RY7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
IFT140Q96RY7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
IFT140Q96RY7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
IFT140Q96RY7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
IFT140Q96RY7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
IFT140Q96RY7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC40.8■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
IFT140Q96RY7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
IFT140Q96RY7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
IFT140Q96RY7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
IFT140Q96RY7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
IFT140Q96RY7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
IFT140Q96RY7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
IFT140Q96RY7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
IFT140Q96RY7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
IFT140Q96RY7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
IFT140Q96RY7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
IFT140Q96RY7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
IFT140Q96RY7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
IFT140Q96RY7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
IFT140Q96RY7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms