Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF13CQ96RJ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF13CQ96RJ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms