Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALPK1Q96QP1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALPK1Q96QP1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms