Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC38A2Q96QD8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC38A2Q96QD8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A2Q96QD8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms