Protein–RNA interactions for Protein: Q96PF2

TSSK2, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK2Q96PF2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TSSK2Q96PF2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSK2Q96PF2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms