Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NSMCE2Q96MF7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NSMCE2Q96MF7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms