Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC74BQ96LY2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC74BQ96LY2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC74BQ96LY2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms