Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNIP3Q96KP6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNIP3Q96KP6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNIP3Q96KP6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNIP3Q96KP6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms