Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BORCS6Q96GS4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BORCS6Q96GS4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BORCS6Q96GS4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
BORCS6Q96GS4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BORCS6Q96GS4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BORCS6Q96GS4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BORCS6Q96GS4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BORCS6Q96GS4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BORCS6Q96GS4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms