Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCD1Q96GM5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCD1Q96GM5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCD1Q96GM5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCD1Q96GM5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms