Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINGO1Q96FE5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINGO1Q96FE5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINGO1Q96FE5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO1Q96FE5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO1Q96FE5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO1Q96FE5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO1Q96FE5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO1Q96FE5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO1Q96FE5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO1Q96FE5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO1Q96FE5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO1Q96FE5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINGO1Q96FE5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINGO1Q96FE5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINGO1Q96FE5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINGO1Q96FE5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINGO1Q96FE5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINGO1Q96FE5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms