Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHFRQ96EP1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHFRQ96EP1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHFRQ96EP1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms