Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC126Q96EE4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC126Q96EE4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC126Q96EE4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms