Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC11Q96DB2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC11Q96DB2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC11Q96DB2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms