Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TLCD1Q96CP7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TLCD1Q96CP7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TLCD1Q96CP7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms