Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF653Q96CK0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF653Q96CK0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF653Q96CK0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF653Q96CK0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms