Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMIGD2Q96BF3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMIGD2Q96BF3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIGD2Q96BF3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMIGD2Q96BF3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms