Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC8Q96B26 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
EXOSC8Q96B26 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXOSC8Q96B26 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms