Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX1

VPS33A, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS33AQ96AX1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS33AQ96AX1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS33AQ96AX1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
VPS33AQ96AX1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS33AQ96AX1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS33AQ96AX1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms