Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTC17Q96AE7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC17Q96AE7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC17Q96AE7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms