Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC35C1Q96A29 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC35C1Q96A29 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC35C1Q96A29 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC35C1Q96A29 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC35C1Q96A29 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC35C1Q96A29 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC35C1Q96A29 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC35C1Q96A29 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms