Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC10Q969S8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC10Q969S8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDAC10Q969S8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC10Q969S8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms