Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HPS3Q969F9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPS3Q969F9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HPS3Q969F9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms