Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNPO1Q92973 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNPO1Q92973 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNPO1Q92973 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms