Protein–RNA interactions for Protein: Q92903

CDS1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS1Q92903 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDS1Q92903 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDS1Q92903 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDS1Q92903 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms