Protein–RNA interactions for Protein: Q92871

PMM1, Phosphomannomutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMM1Q92871 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PMM1Q92871 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PMM1Q92871 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMM1Q92871 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms