Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT9Q92600 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNOT9Q92600 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNOT9Q92600 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms