Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BEST2Q8NFU1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BEST2Q8NFU1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BEST2Q8NFU1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BEST2Q8NFU1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms