Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SPATA4Q8NEY3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SPATA4Q8NEY3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms