Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM3Q8NE01 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNNM3Q8NE01 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNNM3Q8NE01 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNNM3Q8NE01 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms