Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q9

NIPA2, Magnesium transporter NIPA2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA2Q8N8Q9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIPA2Q8N8Q9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIPA2Q8N8Q9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms