Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC9Q8N567 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC9Q8N567 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC9Q8N567 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC9Q8N567 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC9Q8N567 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC9Q8N567 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZCCHC9Q8N567 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZCCHC9Q8N567 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZCCHC9Q8N567 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms