Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC6Q8IVU3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC6Q8IVU3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC6Q8IVU3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms